医院设有呼吸内科、神经内科、心血管内科、血液内科、消化内科、内分泌科、风湿免疫科、肾内科、肿瘤内科、神经外科、肝胆胰外科、乳腺外科、心胸外科、甲状腺外科、胃肠外科/疝与腹壁外、血管外科、关节外科、脊柱外科、修复重建/手外科、创伤骨科、泌尿外科、肛肠外科、整形美容中心、产科、妇科、儿科、小儿外科、新生儿科、眼科、眼视光诊疗中心、耳鼻咽喉科、口腔颌面外科、皮肤性病科、感染科、中医科、重症医学科、麻醉科、放疗科、急诊医学科、健康体检中心、精神卫生科、康复医学科、手术室、介入诊疗中心、输液室、疼痛诊疗中心、全科医学科、放射科、超声医学科、核医学科、医学检验中心、药学部病理科、高压氧科、消毒供应中心、输血科、营养科等临床科室和医技科室。
一、浙江省省重点（扶植）学科：心血管内科、普外科（肝胆外科）。
二、浙江省浙中区域专病中心建设单位：心血管内科、神经内科、肾内科、骨科、肿瘤中心、眼科。
三、丽水市医学重点学科：神经内科、肾内科、消化内科、肿瘤内科、血液科、心胸外科、乳腺外科、胃肠/腹壁疝外科、创伤骨科、重症医学科、妇产科、儿科、口腔科、眼科、康复医学科、介入诊疗中心、放射科（医学影像与介入放射科）、急诊医学科、超声科、检验科、药剂科、保健医学。
四、丽水市重点专科：骨关节科。
五、丽水市医学重点建设学科：麻醉科、外科护理学（心脏外科护理）、护理学。
六、温州医科大学重点学科：心血管内科、血液科。
七、温州医科大学重点扶持学科：心胸外科。
八、医院重点发展科室：肛肠外科。
一、优势病种：帕金森氏病、特发性震颤、多动症、变性疾病、冠心病、心律失常、高血压、心力衰竭、风心病、肺癌、食管癌、纵隔肿瘤、纤维腺瘤、导管内乳头状瘤等、乳腺癌、胆囊结石、肝内外胆管结石、胰管结石、肝外胆道肿瘤、十二指肠乳头癌、胰腺肿瘤、白内障、青光眼、孔源性视网膜脱离、渗出性视网膜脱离、乳腺癌、前列腺癌、甲状腺癌、急慢性白血病、恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、慢性骨髓增殖性疾病。
二、优势技术：心脏直视手术、经皮冠状动脉介入治疗、心律失常射频消融、关节镜手术、脑缺血疾病支架植入、脑血管瘤介入治疗、微创颅内动脉瘤夹闭术、复杂肝胆胰肿瘤切除、瓣膜成形术、准分子近视激光手术、双瓣膜置换术、肺动脉瓣狭窄切开成形、心包剥脱术、肝胆管结石肝叶切除、胰头十二指肠切除、胰体尾切除、白内障超声乳化手术、青光眼滤过术、眼眶肿瘤摘除术、直丝弓矫正技术、标准方丝弓矫正技术、多曲方丝弓矫正技术、口外支抗矫形技术、颅内外动脉支架植入术、颈内动脉椎动脉闭塞开通术。
